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Infrastruktur- und Forschungszentrum für lebenswissenschaftliche Daten und Informationen.

Lebenswissenschaftliche Forschung braucht Infrastruktur.

ZB MED forscht dazu anwendungsorientiert.

InteractOA

Hoch-aufgelöste Referenzierung von Aussagen zu genregulatorischen Interaktion von Bakterien in Open-Access-Publikationen mittels Wikidata

Genaue Quellenangaben bei der Darstellung und Diskussion von Aussagen sind essentieller Bestandteil der wissenschaftlichen Praxis. Wissenschaftliche Datenbanken präsentieren bei einer rapide wachsenden Zahl an Open-Access-Publikationen Daten, Informationen oder Wissen oft ohne Verweis auf die Originalquelle oder nur mit Verweise auf die wissenschaftliche Publikation, nicht aber die genaue Stelle innerhalb dieser Publikation. Dies macht die Nachvollziehbarkeit von Aussagen schwer bis unmöglich und verhindert eine effiziente Prüfung des kollektiven Wissens.

Im Projekt entwickelt ZB MED ein Webtool, das hoch-aufgelöste Quellverweise auf Abschnitte von Open-Access-Publikationen zu Aussagen über bakterielle Genregulationsbeziehungen präsentiert – auch als Prototyp für andere Projekte, bei denen eine fein-granulare Auflösung von Referenzen wünschenswert und möglich ist. Zwingende Grundlage sind Open-Access-publizierte Artikel. Nur für solche Veröffentlichungen können Verweise ohne juristische Barrieren aufgelöst und die referenzierten Stellen beziehungsweise die gesamten Artikel dargestellt werden.

Ein kompilierter Datensatz zu genregulatorischen Interaktionen von bakteriellen Modellorganismen wird mit Hilfe eines im Projekt entwickelten Datenmodells in Wikidata gespeichert. Diese kollaborativ editierbare Datenbank betreibt die Wikimedia Community. Die gespeicherten Daten können dann mit dem neuen Webtool durchsucht und visualisiert werden. Dies beinhaltet auch die Darstellung der Aussage im Text der Quell-Open-Access-Publikationen.

Laufzeit

01.11.2018 - 30.06.2019

Drittmittelgeber

Bundesministeriums für Bildung und Forschung (BMBF)

Ergebnis

Zum Webtool